Pour le bon déroulement des activités de la CCISE, les membres du Conseil constituent de diverses commissions :

• Commission des finances
• Commission des marchés
• Commission de la formation
• Commission des PME
• Commission des manifestations
• Commission de la promotion des investissements et des exportations
• Commission de commerce
• Commission de l'industrie
• Commission de la promotion de l'artisanat
• Commission des petits métiers
• Commission des relations internationales
• Commission de l'arbitrage